Die Einspülung begann im Jahre 1953 und endete 1976. Heute steht das 272 Hektar große Gelände des ehemaligen Klärteiches 3, einschließlich eines kleinen Restes des ehemaligen Waldes, unter Naturschutz.
Die Kreisgruppe Salzgitter des Naturschutzbundes (NABU) stellte hier in langjährigen Bestandserhebungen 301 Vogelarten fest; 115 von ihnen sind in ihrem Bestand bedroht.
Zu ihnen zählen unter anderem Kranich, Fischadler, Kormoran und Flußuferläufer, die den See als Trittstein auf dem Weg in die Überwinterungs- oder Brutgebiete aufsuchen.
Für Naturliebhaberinnen und Naturliebhaber ist eine Wandertour um das Naturschutzgebiet und Europäische Vogelreservat Heerter See ein besonderes Erlebnis. Sein salzhaltiges Wasser bietet Lebensraum für spezielle Pflanzenarten und seine flachen Uferzonen eignen sich ideal für Watvögel.
Mit dem Heerter See zählt Salzgitter 287 Hektar Landschaftsschutzgebiete.