L'église Saint-Jacques de Vöppstedt, mentionnée pour la première fois dans un document du 12e siècle, constituait le noyau de l'ancien village de Vöppstedt, qui devait probablement être bien plus ancien.
À partir de 1331, les habitants se sont installés dans la ville fortifiée de Salzgitter et ont construit l'église Marienkirche. L'église du village, devenue sans défense, a été détruite soit lors de la querelle de la bière entre 1481 et 1486, soit lors de la querelle de l'abbaye de Hildesheim entre 1519 et 1523. En 1591, elle a été reconstruite en tant que chapelle des morts et le village environnant, devenu désert, a été utilisé comme cimetière.
Au fil des siècles, des morts ont également été enterrés dans la chapelle. Les registres paroissiaux donnent des informations plus ou moins précises sur les membres des familles du patronage et du curé enterrés dans la maison de Dieu, qui ont souvent dû revendiquer durement leur droit à un lieu d'inhumation privilégié. Pendant la guerre de Trente Ans, la chapelle tomba à nouveau en ruine et ne fut rénovée qu'en 1683.
Le 20 mai 1807 représente probablement la rupture la plus radicale dans l'utilisation du bâtiment, lorsque le commandant français de la ville, La Chaise, demanda au surintendant Feyerabend de vider la chapelle de tous ses meubles dans un délai d'un jour, afin de faire de la place pour les prisonniers faits par l'armée française. Ainsi, pendant l'occupation française, la maison de Dieu devint à la fois une prison et un magasin de fourrage.
Dans les années qui suivirent, il fut même envisagé de démolir la chapelle afin de rénover l'église salzbourgeoise de Sainte-Marie-Jacobi avec le produit de la vente des matériaux de construction. Mais cela ne se fit pas, ce qui n'empêcha pas la chapelle de continuer à se dégrader. En 1863, le toit de la tour s'effondra et en 1924, le toit de la nef dut être retiré pour des raisons de sécurité.
Vers 1900, le murage de l'arc sur le côté est de la nef s'est effondré, révélant ainsi l'ouverture qui peut être considérée comme la séparation entre la nef et un probable chœur, non attesté dans la littérature de la chapelle, comme fermeture orientale.
Au cours des années jusqu'en 1940, l'état de l'édifice se dégrada à tel point qu'il dut être largement condamné. Ce n'est qu'après 1960 que l'administration de la ville de Salzgitter décida de réutiliser le cimetière et la chapelle comme lieu de commémoration des victimes des deux guerres mondiales et de la tyrannie ou de sécuriser les ruines de la chapelle conformément aux règles de protection des monuments. Après 1980, une plaque commémorative a été apposée pour les victimes de l'accident minier de la Hannoversche Treue.
En 1886, le cimetière protestant de la vieille ville fut créé et c'est ainsi que la part des enterrements dans le cimetière de Vöppstedt diminua de plus en plus jusqu'à ce que, probablement en 1920, la dernière inhumation ait lieu dans une tombe familiale. Aujourd'hui, seuls quelques monuments et un mausolée témoignent encore des personnes qui ont peuplé Salzgitter.