Chronione biotopy to siedliska szczególnych gatunków roślin i zwierząt. Siedliska te zasługują na szczególną ochronę, ponieważ są rzadkie, mają wysoką wartość ekologiczną i/lub są zagrożone zniszczeniem.

Istnieją przepisy i umowy międzynarodowe mające na celu ochronę tych siedlisk. W Dolnej Saksonii następujące typy biotopów są objęte specjalną ochroną prawną na mocy sekcji 30 ustawy o ochronie przyrody i zarządzaniu krajobrazem (BNatSchG):

• Naturalne lub zbliżone do naturalnych obszary płynących i stojących wód śródlądowych, w tym ich brzegi i związana z nimi naturalna lub zbliżona do naturalnej roślinność wzdłuż brzegów, a także ich naturalne lub zbliżone do naturalnych obszary zamulania, starorzecza i regularnie zalewane obszary,
• Torfowiska, bagna, trzcinowiska, łąki turzycowe, podmokłe łąki bogate w turzyce i szuwary, obszary źródliskowe, śródlądowe słone bagna,
• otwarte wydmy śródlądowe, otwarte naturalne zbocza głazów, gruzu i piargu, ściany gliniaste i lessowe, krzewy karłowate, wrzosowiska żarnowcowe i jałowcowe, murawy szczeciniaste, suche murawy, murawy z metalami ciężkimi, lasy i zarośla w suchych i ciepłych miejscach,
• kamieniołomy, lasy bagienne i aluwialne, wąwozy, głazy i lasy gruzowe na zboczach, subalpejskie lasy modrzewiowe i modrzewiowo-sosnowe,
• otwarte formacje skalne, jaskinie i niemal naturalne tunele, murawy alpejskie, doliny śnieżne i zarośla krummholz,
• Skaliste i strome wybrzeża, wydmy nadmorskie i wały plażowe, jeziora plażowe, laguny z obszarami zamulonymi, słone bagna i muliste równiny na obszarach przybrzeżnych, łąki trawy morskiej i inne stanowiska makrofitów morskich, rafy, piaszczyste ławice przybrzeżne, muliste równiny z megafauną denną i bogatymi gatunkowo żwirowymi, gruboziarnistymi piaskami i żwirowiskami na obszarach morskich i przybrzeżnych,
• chude łąki nizinne i górskie zgodnie z załącznikiem I do dyrektywy 92/43/EWG, sady, kamienie i suche kamienne mury.

Ponadto następujące typy biotopów są objęte specjalną ochroną prawną zgodnie z sekcją 24 ustawy o ochronie przyrody Dolnej Saksonii (NNatSchG):

• bogate w wysokie zioła podmokłe łąki i inne bogate gatunkowo podmokłe i wilgotne użytki zielone,
• łąki górskie,
• łąki mezofilne,
• łąki i pastwiska z drzewami owocowymi o powierzchni ponad 2500 m ²z wysokopiennymi drzewami owocowymi o wysokości pnia ponad 1,60 m (sady) oraz
• zapadliska.

Ochrona innych biotopów może wynikać ze specjalnych przepisów prawnych dotyczących ochrony niektórych obszarów.

Działania, które mogłyby doprowadzić do zniszczenia lub znacznego pogorszenia stanu tych siedlisk wraz z ich typową florą i fauną, są zabronione. Wyjątki mogą być dozwolone w indywidualnych przypadkach, jeśli negatywne skutki mogą zostać zrekompensowane. Uszkodzenie i zniszczenie specjalnie chronionych biotopów spowodowane ignorancją jest również nielegalne. Zanieczyszczający może być zobowiązany do przywrócenia stanu pierwotnego.

Prawnie chronione biotopy są rejestrowane przez gminę, wspólną gminę i miasto oraz wpisywane do rejestru chronionych części przyrody i krajobrazu. Właściciele i upoważnieni użytkownicy są powiadamiani pisemnie o wpisie do tego rejestru. Gminy, wspólne gminy i miasta przechowują wyciągi z tego rejestru. Każdy może sprawdzić ten rejestr i wyciągi zgodnie z § 14 NAGBNatSchG.